Chùa Nam Nhã do ông Nguyễn Giác Nguyên đứng ra xây dựng năm 1895, theo tông phái Minh Sư nên còn được gọi là chùa Minh Sư. Chùa Nam Nhã nổi tiếng không chỉ về vẻ đẹp kiến trúc Á - Âu kết hợp, hài hòa với thiên nhiên, mà còn bởi lịch sử hình thành và phát triển của chùa song hành với phong trào cách mạng kháng chiến chống Pháp. Đây từng là trụ sở chính của phong trào Đông Du (1907 - 1940) do Phan Bội Châu khởi xướng. Trong thời kỳ này, chùa đã tự tổ chức ra nhiều cơ sở kinh tài nhằm chu cấp cho du học sinh, chống lại chính sách ngu dân của thực dân Pháp.
